استفاده از نشانگر RAPD برای ارزیابی گوناگونی ژنتیکی برخی از گونه‌های آویشن

Authors

  • سیده بی‌بی لیلا علمداری کارشناس‌ارشد، بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
  • عباس صفرنژاد دانشیار، مرکز تحقیقات کشاورزی و منابع طبیعی خراسان رضوی
  • قربانعلی نعمت‌زاده استاد، اصلاح نباتات، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری
Abstract:

سیزده نمونه از گیاه دارویی آویشن، شامل10 نمونه از گونه بومی Thymus daenensis  و نمونه‌های دیگر مربوط به گونه‌های T. migricus, T. pubsence  و T. fedtschenkoi مورد ارزیابی‌ ژنتیکی قرار گرفتند. به‌منظور ارزیابی تنوع مولکولی نمونه‌های آویشن، DNA ژنومی به صورت بالک با استفاده از روش CTAB با کمی تغییرات، استخراج گردید. برای انجام واکنش PCR از20 آغازگر رپید استفاده گردید که تنها 8 آغازگر باندهای واضح و تکرارپذیر را نشان دادند. از مجموع 97 باند تولید شده 61% باندها چند شکل بودند. بیشترین تعداد قطعه تکثیر شده (16عدد) مربوط به آغازگرOPA9 و کمترین تعداد (8 عدد) مربوط به آغازگر OPP3 بود. نمونه‌های شماره 8 (daenensis subs daenensis T.) و 10 ( T. daenensis subs daenensis) در کمترین فاصله ژنتیکی (شباهت 92%)  نسبت به هم و نمونه‌های شماره 2 ( T. migricus ) و 11 (T. daenensis subs daenensis) در دورترین فاصله (شباهت 75%) نسبت به هم قرار داشتند. میانگین تنوع ژنی نی برابر با 2087/0 به‌دست آمد. دندروگرام ترسیم شده در فاصله ژنتیکی 80% دو گروه اصلی را بین 13 نمونه مشخص کرد. در یک گروه نمونه‌هایی از سه گونهT. migricus ،T. daenensis  و T. pubsence قرار گرفتند و در گروه دوم دو گونهT.daenensis subs daenensis   و T. fedtschenkoi قرار گرفتند. به‌طورکلی بررسی تنوع در ژنوتیپ‌های آویشن با استفاده از نشانگر رپید نشان داد که این نشانگر در شناسایی نواحی چند شکلی و تخمین فاصله ژنتیکی و مدیریت ژرم‌پلاسم می‌تواند مفید باشد

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

استفاده از نشانگر rapd برای ارزیابی گوناگونی ژنتیکی برخی از گونه های آویشن

سیزده نمونه از گیاه دارویی آویشن، شامل10 نمونه از گونه بومی thymus daenensis  و نمونه های دیگر مربوط به گونه های t. migricus, t. pubsence  و t. fedtschenkoi مورد ارزیابی ژنتیکی قرار گرفتند. به منظور ارزیابی تنوع مولکولی نمونه های آویشن، dna ژنومی به صورت بالک با استفاده از روش ctab با کمی تغییرات، استخراج گردید. برای انجام واکنش pcr از20 آغازگر رپید استفاده گردید که تنها 8 آغازگر باندهای واضح و...

full text

ارزیابی گوناگونی ژنتیکی ژنوتیپ های انار(Punica granatum) طارم زنجان با استفاده از نشانگر مولکولی RAPD

انار یکی از مهمترین میوه‌هایی است که ایران مرکز و کشت و کار آن در دنیا بشمار می‌رود و غنی‌ترین ذخایر ژنتیکی انار دنیا در ایران وجود دارد. در این مطالعه تنوع ژنتیکی 15 نمونه انار مربوط به شهرستان طارم زنجان با استفاده از نشانگر مولکولی RAPD مورد بررسی قرار گرفت. DNA ژنومی از برگ‌ها استخراج، و از نظر ویژگی های کمی و کیفی در واکنش PCR، مورد ارزیابی قرار گرفتند. از تعداد 39 آغازگر تصادفی 10 نوکلئوت...

full text

بررسی تنوع ژنتیکی و روابط فیلوژنتیک برخی گونههای جنس زعفران موجود در ایران با استفاده از نشانگر RAPD

زعفران ( . Crocus spp ) از جمله گیاهان بومی ایران است که دارای خواص دارویی و ادوی های متعدد می باشد و به لحاظ اقتصادی در ایران و جهان حائز اهمیت است. یکی از کاربردهای مهم تکنیک های مولکولی بررسی و برآورد سطح تنوع ژنتیکی در ژر مپلاسم ها و جمعیت ها، برای استفاده مطلوب از آن ها در به نژادی و مدیریت حفظ ذخایر ژنتیکی گیاهان می باشد. به این منظور در تحقیق حاضر تنوع و ارتباط ژنتیکی 25 نمونه از زعفران ...

full text

ارزیابی تنوع ژنتیکی برخی از ژنوتیپ‎های سیب ایران با استفاده از نشانگر RAPD

      جمع­آوری و ارزیابی ژرم­پلاسم­ها در برنامه­های اصلاحی درختان میوه دارای نقش اساسی است. نشانگرهای مولکولی متفاوتی برای این نوع ارزیابی­ها به­کار برده شده­اند که مارکر RAPD جزء مارکرهای پرکاربرد در مورد شناسایی ژنوتیپ­ها و ارقام گوناگون سیب می­باشد. در این پژوهش تنوع ژنتیکی 23 ژنوتیپ بومی ایران (از سه منطقه آذربایجان، البرز مرکزی و زاگرس مرکزی) و رقم تجاری گرانی­اسمیت به عنوان شاهد توسط 11 آ...

full text

ارزیابی گوناگونی ژنتیکی ژنوتیپ های انار(punica granatum) طارم زنجان با استفاده از نشانگر مولکولی rapd

انار یکی از مهمترین میوه هایی است که ایران مرکز و کشت و کار آن در دنیا بشمار می رود و غنی ترین ذخایر ژنتیکی انار دنیا در ایران وجود دارد. در این مطالعه تنوع ژنتیکی 15 نمونه انار مربوط به شهرستان طارم زنجان با استفاده از نشانگر مولکولی rapd مورد بررسی قرار گرفت. dna ژنومی از برگ ها استخراج، و از نظر ویژگی های کمی و کیفی در واکنش pcr، مورد ارزیابی قرار گرفتند. از تعداد 39 آغازگر تصادفی 10 نوکلئوت...

full text

بررسی تنوع ژنتیکی برخی از پایه های پاکوتاه کننده سیب با استفاده از نشانگر مولکولی RAPD

در این تحقیق تنوع ژنتیکی 19 پایه اصلاح شده سیب در انگلستان و روسیه که از مناطق مختلف ایران جمع آوری شده همراه با 12 ژنوتیپ و پنج نمونه حاصل از کشت بافت به کمک نشانگرDNA (RAPD) مورد بررسی قرار گرفت. تعداد 100 آغازگر تصادفی در انجام واکنش PCR روی نمونه ها ارزیابی شد که 10 آغازگر تکثیر DNA الگو را به خوبی انجام داده و بین نمونه ها چند شکلی قابل ملاحظه ای نشان دادند. این 10 آغاز گر در مجموع 160 بان...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


Journal title

volume 20  issue 2

pages  192- 201

publication date 2013-02-19

By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023